人類利用微生物製造有用產物，這些產物可能是微生物本身（例如用於釀酒和製造麵包的酵母）或微生物的代謝產物（例如酶和抗生素）。

微生物被廣泛用於產品製造的原因如下：

1. 繁殖迅速：短時間內能培養大量微生物，並能生成大量有用生成物；
2. 營養素需求簡單：有些微生物可在廢棄物料上生長；
3. 快速地把原料轉化為生成物：相對於動物和植物，微生物能更快速、更有效地把原料轉化為生成物；
4. 能簡單地提取和淨化生成物：只需使用相對簡單的方法，就能提取和淨化微生物的生成物；
5. 在發酵罐內就能大量培養微生物：相比動物和植物，大量培養微生物所需的空間小很多；
6. 相對容易進行基因改造：相比動物和植物，對微生物進行基因改造較容易，從而易於生產某些產品；
7. 特殊條件下的產品：利用生活在極端環境（如火山熱泉）中的微生物，可生產基因工程所需的特殊酶。

工業上，我們可利用發酵罐大量培養微生物（異營生物）。

發酵罐內的環境，包括溫度、pH 值、氧濃度和營養素供應，都受到嚴格調控，以提供合適的生長條件，讓微生物快速生長。培養過程中所用的容器、營養素和空氣，都必須經過嚴格滅菌，防止培養物受到污染。