除了地理隔離，也有其他隔離的機制，令種群即使生活在同一個地方，也被「隔離」起來，導致種群漸漸向獨立的方向進化，最後成為新的物種。

其中，有時間隔離、行為隔離和雜種不育性。

時間隔離，就是種群的生活習慣，出現時間上的差異，導致兩個種群即使生活在同一個地區，也因時間的原因而不會出現雜交繁殖。

例如種群在不同的季節進行繁殖，或是一天內不同的時間活動，均會導致牠們不會相遇和進行雜交繁殖。

不同的活動時間導致時間隔離

即使生活在同一個地區，活躍於同一個時段，兩個種群也有機會出現隔離，原因可能是「行為隔離」 。

許多較高等的動物皆會出現「擇偶」的行為。若一個種群的個體出現了不同的求偶行為，另一個種群的個體就有機會不以牠為交配的對象，結果就形成隔離，即種群間不能再出現雜交繁殖。

當兩個種群之間的雜交繁殖，所產生的後代不能發育至性成熟，就會出現隔離。例如產生的後代有缺憾，以至不能成長到性成熟的年齡。