地理隔離，就是因為地理的緣故，把種群分隔開，導致遭隔離的種群獨立進行進化，最後成為新的物種。

地球上每一種生物，都要在指定的物理條件下才能生存；若該環境不能提供符合的物理條件，生物就不能在其中生存，例如：魚類不能在乾旱的陸地生存、大猩猩只能在雨木中生存等等。

任何地理環境都有機會成為屏障，導致一個種群被隔離，即其中的生物個體不能越過屏障，與外面的個體相遇及進行雜交繁殖。

對於許多陸地生物來說，海洋是一個既龐大、又難以跨越的地理屏障。

一些偶發性的事件，例如海平面上升，導致一些原與大陸連接的陸地，後遭海洋隔離而成為島嶼。其中的生物種群，就會分別獨立的進化，成為獨特的物種。

許多遠離大陸的島嶼，都有獨有的物種 (endemism) ，例如澳洲的無尾熊和紅袋鼠、毛里求斯的渡度鳥。牠們的出現，相信與海洋成為地理隔離有關。

一些因海洋隔離而出現的獨特物種的例子

溪流、湖泊等淡水本來就是較為「分隔」的生境，基於氣候的改變，如暴雨或乾旱，皆有機會導致溪流和湖泊發生改變，形成獨立、被隔離的環境。居住其中的生物，在長期被隔離的情況下，就有機會獨立進化成獨特的物種。

香港的溪流也有一些獨特的淡水魚類物種，是基於地理的隔離而進化成的。

山脈也是一種重要地理隔離障礙。

由於地殼變動的原因，地球上有多個大型的山脈，海拔高度達幾千公尺，長度達數千公里，峰頂長期被冰覆蓋，例如著名的喜馬拉雅山脈、安地斯山脈、阿爾卑斯山脈等等。

許多陸地生物 (包括部份鳥類) 皆無法跨離大型的山脈，而與山脈外的種群隔離，漸漸在山脈的兩側則分別進化出不同的新物種。